​​​​​​​
هم اکنون 87 نسخه خطی ارزشمند از آثار سعدی در این موقوفه نگهداری می‌شود که منتخبی از نفیس‌ترین آن‌ها در بعضی از تالارهای موزه ملی ملک در معرض نمایش عموم گذاشته شده است. در کتابخانه ملی ملک هم 10 نسخه چاپ سنگی از آثار سعدی شیرازی وجود دارد. همچنین در تالار خوشنویسی و نگارگری این موزه نمونه‌هایی از مرقعات خوشنویسی، مزین به شعرهای سعدی به چشم می‌خورد که توسط خوشنویسان بنام کشور در دوره‌های تاریخی همچون صفویه و قاجاریه نگاشته شده است. کتابخانه ملی ملک کتاب‌های چاپی متعددی از آثار سعدی دارد که در این ‌بین می‌توان به یک نسخه گلستان سعدی به زبان روسی با قدمت 168 سال اشاره کرد که در سال 1857 میلادی منتشر شده است.کلیات سعدی که در سال 1324 هجری قمری توسط «میرزا علی نقی شیرازی» در افزون بر 500 صفحه کتابت و توسط «میرزا محمود مذهب‌باشی شیرازی» مجلد شده است، نفیس‌ترین نسخه خطی از آثار سعدی در کتابخانه و موزه ملی ملک به شمار می‌آید. به گزارش نسیم رضوان، جالب است بدانید که این نسخه خطی از جمله آثار فاخری بوده که از ایران خارج شده بود و به واسطه خیراندیشی بانو عزت‌مند ملک، دختر بزرگ حاج حسین آقا ملک در یکی از حراجی‌های بین‌المللی خریداری شد و اکنون به‌عنوان یکی از آثار مجموعه اهدایی این بانوی فرهیخته در گنجینه ملک نگهداری می‌شود. این اثر یکی از نسخه‌های بسیار کامل کلیات سعدی به شمار می‌آید تا جایی که آن را می‌توان نسخه معیار یا اساس برای خواندن کلیات سعدی قرار داد. گفتنی است کتابخانه و موزه ملی ملک تهران در سال ۱۳۱۶ شمسی وقف حرم مطهر رضوی شده و امروزه آماده خدمات‌رسانی به اهل هنر و تاریخ است.